MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sorangium cellulosum So0157-2

Total Repeats: 354323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021658	CG	3	6	23	28	0 %	0 %	50 %	50 %	521459874
2	NC_021658	AGTTC	2	10	99	108	20 %	40 %	20 %	20 %	521459874
3	NC_021658	GAT	2	6	109	114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521459874
4	NC_021658	GGTC	2	8	224	231	0 %	25 %	50 %	25 %	521459874
5	NC_021658	CGAT	2	8	245	252	25 %	25 %	25 %	25 %	521459874
6	NC_021658	GTG	2	6	316	321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	521459874
7	NC_021658	CGA	2	6	326	331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459874
8	NC_021658	GCG	2	6	334	339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459874
9	NC_021658	CCGGCG	2	12	340	351	0 %	0 %	50 %	50 %	521459874
10	NC_021658	CCCCG	2	10	352	361	0 %	0 %	20 %	80 %	521459874
11	NC_021658	GAC	2	6	394	399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459874
12	NC_021658	TCG	2	6	428	433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459874
13	NC_021658	CGG	3	9	473	481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459874
14	NC_021658	GCG	2	6	482	487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459874
15	NC_021658	GCC	2	6	491	496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459874
16	NC_021658	GCG	2	6	518	523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459874
17	NC_021658	GC	3	6	592	597	0 %	0 %	50 %	50 %	521459874
18	NC_021658	ATC	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521459874
19	NC_021658	ACGA	2	8	625	632	50 %	0 %	25 %	25 %	521459874
20	NC_021658	TCA	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521459874
21	NC_021658	CAC	2	6	652	657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	521459874
22	NC_021658	CG	4	8	673	680	0 %	0 %	50 %	50 %	521459874
23	NC_021658	TGC	2	6	701	706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459874
24	NC_021658	CGA	2	6	711	716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459874
25	NC_021658	AGG	2	6	749	754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	521459874
26	NC_021658	TTC	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521459874
27	NC_021658	GTG	2	6	802	807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	521459874
28	NC_021658	TCG	2	6	878	883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459874
29	NC_021658	CG	3	6	911	916	0 %	0 %	50 %	50 %	521459874
30	NC_021658	GGC	2	6	936	941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459874
31	NC_021658	CGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459874
32	NC_021658	GGC	2	6	1038	1043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459874
33	NC_021658	GCTC	2	8	1049	1056	0 %	25 %	25 %	50 %	521459874
34	NC_021658	GCC	2	6	1061	1066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459874
35	NC_021658	CG	4	8	1083	1090	0 %	0 %	50 %	50 %	521459874
36	NC_021658	CGC	3	9	1109	1117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459874
37	NC_021658	GAT	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521459874
38	NC_021658	GC	3	6	1149	1154	0 %	0 %	50 %	50 %	521459874
39	NC_021658	CCA	2	6	1161	1166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	521459874
40	NC_021658	TCGA	2	8	1180	1187	25 %	25 %	25 %	25 %	521459874
41	NC_021658	CG	3	6	1224	1229	0 %	0 %	50 %	50 %	521459874
42	NC_021658	AGC	2	6	1253	1258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459874
43	NC_021658	CGGG	2	8	1284	1291	0 %	0 %	75 %	25 %	521459874
44	NC_021658	TGA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521459874
45	NC_021658	GAA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	521459874
46	NC_021658	CGA	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459874
47	NC_021658	GC	4	8	5482	5489	0 %	0 %	50 %	50 %	521459875
48	NC_021658	CGGCG	2	10	5512	5521	0 %	0 %	60 %	40 %	521459875
49	NC_021658	CG	4	8	5520	5527	0 %	0 %	50 %	50 %	521459875
50	NC_021658	GCTC	2	8	5533	5540	0 %	25 %	25 %	50 %	521459875
51	NC_021658	CGC	2	6	5549	5554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459875
52	NC_021658	CG	3	6	5560	5565	0 %	0 %	50 %	50 %	521459875
53	NC_021658	CGC	2	6	5635	5640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
54	NC_021658	GC	3	6	5650	5655	0 %	0 %	50 %	50 %	521458882
55	NC_021658	CGC	2	6	5659	5664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
56	NC_021658	CGC	3	9	5682	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
57	NC_021658	AGC	2	6	5696	5701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521458882
58	NC_021658	GAG	2	6	5737	5742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	521458882
59	NC_021658	TCG	2	6	5910	5915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
60	NC_021658	CCT	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	521458882
61	NC_021658	CG	3	6	5955	5960	0 %	0 %	50 %	50 %	521458882
62	NC_021658	TCG	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
63	NC_021658	GCGG	2	8	6029	6036	0 %	0 %	75 %	25 %	521458882
64	NC_021658	CGG	2	6	6075	6080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521458882
65	NC_021658	TCG	2	6	6138	6143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
66	NC_021658	CGCTC	2	10	6153	6162	0 %	20 %	20 %	60 %	521458882
67	NC_021658	GTG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	521458882
68	NC_021658	CGC	3	9	6204	6212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
69	NC_021658	GCG	2	6	6234	6239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521458882
70	NC_021658	GAG	2	6	6247	6252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	521458882
71	NC_021658	TCG	2	6	6260	6265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
72	NC_021658	GCG	2	6	6281	6286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521458882
73	NC_021658	GCGCC	2	10	6294	6303	0 %	0 %	40 %	60 %	521458882
74	NC_021658	CGA	2	6	6309	6314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521458882
75	NC_021658	TCG	2	6	6317	6322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
76	NC_021658	GAA	2	6	6352	6357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	521458882
77	NC_021658	CCG	2	6	6366	6371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
78	NC_021658	CGG	2	6	6378	6383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521458882
79	NC_021658	GCC	2	6	6397	6402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
80	NC_021658	ACC	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	521458882
81	NC_021658	CGG	2	6	6423	6428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521458882
82	NC_021658	CCG	2	6	6478	6483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
83	NC_021658	ATCG	2	8	6524	6531	25 %	25 %	25 %	25 %	521458882
84	NC_021658	CGC	2	6	6549	6554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
85	NC_021658	CGA	3	9	6598	6606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521458882
86	NC_021658	CCG	2	6	6627	6632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
87	NC_021658	CCT	2	6	6633	6638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	521458882
88	NC_021658	GATC	2	8	6672	6679	25 %	25 %	25 %	25 %	521458882
89	NC_021658	TCG	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
90	NC_021658	GAT	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521458882
91	NC_021658	CGC	2	6	6738	6743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
92	NC_021658	CGC	2	6	6756	6761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
93	NC_021658	CGC	2	6	6822	6827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458882
94	NC_021658	CGG	2	6	6888	6893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521458882
95	NC_021658	TGA	2	6	6903	6908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521458882
96	NC_021658	TCG	2	6	6948	6953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
97	NC_021658	CGT	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
98	NC_021658	CAC	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	521458882
99	NC_021658	ATC	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521458882
100	NC_021658	G	6	6	7072	7077	0 %	0 %	100 %	0 %	521458882
101	NC_021658	CGA	2	6	7128	7133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521458882
102	NC_021658	TGCT	2	8	7157	7164	0 %	50 %	25 %	25 %	521458882
103	NC_021658	GC	3	6	7173	7178	0 %	0 %	50 %	50 %	521458882
104	NC_021658	GCGCC	2	10	7243	7252	0 %	0 %	40 %	60 %	521458882
105	NC_021658	CGT	2	6	7303	7308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
106	NC_021658	GC	4	8	7309	7316	0 %	0 %	50 %	50 %	521458882
107	NC_021658	CGT	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
108	NC_021658	CGA	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521458882
109	NC_021658	CACG	2	8	7381	7388	25 %	0 %	25 %	50 %	521458882
110	NC_021658	TCG	2	6	7392	7397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521458882
111	NC_021658	CGC	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459876
112	NC_021658	GGC	2	6	7627	7632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459876
113	NC_021658	CGGG	2	8	7638	7645	0 %	0 %	75 %	25 %	521459876
114	NC_021658	GAC	3	9	7654	7662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459876
115	NC_021658	CGC	2	6	7666	7671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459876
116	NC_021658	GAC	2	6	7720	7725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459876
117	NC_021658	GCCG	2	8	7726	7733	0 %	0 %	50 %	50 %	521459876
118	NC_021658	CTG	2	6	7753	7758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459876
119	NC_021658	CGG	2	6	7797	7802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459876
120	NC_021658	CGA	2	6	7836	7841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459876
121	NC_021658	CGAC	2	8	7872	7879	25 %	0 %	25 %	50 %	521459876
122	NC_021658	GC	3	6	7890	7895	0 %	0 %	50 %	50 %	521459876
123	NC_021658	GTGG	2	8	7903	7910	0 %	25 %	75 %	0 %	521459876
124	NC_021658	GC	3	6	7913	7918	0 %	0 %	50 %	50 %	521459876
125	NC_021658	CGG	3	9	8025	8033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459876
126	NC_021658	GCA	2	6	8037	8042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459876
127	NC_021658	GCT	2	6	8043	8048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459876
128	NC_021658	CG	3	6	8057	8062	0 %	0 %	50 %	50 %	521459876
129	NC_021658	GCT	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459876
130	NC_021658	CCG	2	6	8115	8120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459876
131	NC_021658	CCG	2	6	8145	8150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459876
132	NC_021658	CCG	2	6	8591	8596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459877
133	NC_021658	CGCC	2	8	8624	8631	0 %	0 %	25 %	75 %	521459877
134	NC_021658	CGC	2	6	8636	8641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459877
135	NC_021658	CCT	2	6	8661	8666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	521459877
136	NC_021658	CTCG	2	8	8775	8782	0 %	25 %	25 %	50 %	521459877
137	NC_021658	TTC	2	6	8854	8859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521459877
138	NC_021658	GAG	2	6	8884	8889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	521459877
139	NC_021658	CTT	2	6	8919	8924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521459877
140	NC_021658	GC	3	6	8968	8973	0 %	0 %	50 %	50 %	521459877
141	NC_021658	CTT	2	6	8979	8984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521459877
142	NC_021658	ATC	2	6	9013	9018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521459877
143	NC_021658	CTCG	2	8	9102	9109	0 %	25 %	25 %	50 %	521459877
144	NC_021658	GC	3	6	9150	9155	0 %	0 %	50 %	50 %	521459877
145	NC_021658	GCG	2	6	9209	9214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459877
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147	NC_021658	CTG	2	6	9277	9282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459877
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149	NC_021658	ACG	2	6	9341	9346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459877
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151	NC_021658	CGG	3	9	9384	9392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459877
152	NC_021658	GC	3	6	9404	9409	0 %	0 %	50 %	50 %	521459877
153	NC_021658	TGC	2	6	9413	9418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459877
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155	NC_021658	CGG	2	6	9468	9473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459877
156	NC_021658	GC	3	6	9496	9501	0 %	0 %	50 %	50 %	521459877
157	NC_021658	GTC	2	6	9514	9519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459877
158	NC_021658	GCC	2	6	9541	9546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459877
159	NC_021658	GCG	2	6	9554	9559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459877
160	NC_021658	AGC	2	6	9560	9565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459877
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162	NC_021658	CGC	2	6	9588	9593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459877
163	NC_021658	GCGCGG	2	12	9621	9632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459877
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165	NC_021658	CG	5	10	9688	9697	0 %	0 %	50 %	50 %	521459877
166	NC_021658	TGC	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459877
167	NC_021658	GCA	2	6	9725	9730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459877
168	NC_021658	CGC	2	6	9746	9751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459877
169	NC_021658	CGA	2	6	9777	9782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459877
170	NC_021658	GGC	2	6	12309	12314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521458883
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174	NC_021658	GTG	2	6	12474	12479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	521458883
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176	NC_021658	CGC	2	6	12545	12550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521458883
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179	NC_021658	GCG	2	6	12647	12652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521458883
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188	NC_021658	CGA	2	6	12985	12990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459878
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200	NC_021658	CGA	2	6	13282	13287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459878
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242	NC_021658	GC	3	6	14709	14714	0 %	0 %	50 %	50 %	521459879
243	NC_021658	GC	3	6	14765	14770	0 %	0 %	50 %	50 %	521459879
244	NC_021658	CGGCG	2	10	14772	14781	0 %	0 %	60 %	40 %	521459879
245	NC_021658	GCGAGG	2	12	14797	14808	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	521459879
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252	NC_021658	CCA	2	6	15360	15365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	521459880
253	NC_021658	CGAC	2	8	15392	15399	25 %	0 %	25 %	50 %	521459880
254	NC_021658	CG	3	6	15400	15405	0 %	0 %	50 %	50 %	521459880
255	NC_021658	TCG	2	6	15428	15433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459880
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257	NC_021658	GCGA	2	8	15502	15509	25 %	0 %	50 %	25 %	521459880
258	NC_021658	CGG	2	6	15557	15562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459880
259	NC_021658	TCG	2	6	15563	15568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459880
260	NC_021658	CGA	2	6	15617	15622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459880
261	NC_021658	GCT	2	6	15633	15638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459880
262	NC_021658	TCGA	2	8	15685	15692	25 %	25 %	25 %	25 %	521459880
263	NC_021658	CGCC	2	8	15786	15793	0 %	0 %	25 %	75 %	521459880
264	NC_021658	CGA	2	6	15801	15806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459880
265	NC_021658	GCGCC	2	10	15831	15840	0 %	0 %	40 %	60 %	521459880
266	NC_021658	GCA	2	6	15851	15856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459880
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269	NC_021658	GATC	2	8	15915	15922	25 %	25 %	25 %	25 %	521459880
270	NC_021658	TGA	2	6	15959	15964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521459880
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272	NC_021658	GAG	2	6	15982	15987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	521459880
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291	NC_021658	GGC	2	6	16480	16485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521459881
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304	NC_021658	TCG	2	6	16887	16892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459881
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381	NC_021658	CGGC	2	8	18938	18945	0 %	0 %	50 %	50 %	521459883
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391	NC_021658	CGC	2	6	19236	19241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521459883
392	NC_021658	TTC	2	6	19243	19248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521459883
393	NC_021658	G	6	6	19299	19304	0 %	0 %	100 %	0 %	521459883
394	NC_021658	GC	3	6	19307	19312	0 %	0 %	50 %	50 %	521459883
395	NC_021658	GCT	2	6	19317	19322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459883
396	NC_021658	CGCCGT	2	12	19338	19349	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	521459883
397	NC_021658	CGA	2	6	19419	19424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521459883
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400	NC_021658	GCT	2	6	19485	19490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521459883
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498	NC_021658	GCCGA	2	10	22505	22514	20 %	0 %	40 %	40 %	521459884
499	NC_021658	GC	4	8	22517	22524	0 %	0 %	50 %	50 %	521459884
500	NC_021658	GCCGA	2	10	22531	22540	20 %	0 %	40 %	40 %	521459884

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